Největším problémem, který je třeba výchovou a výcvikem zvládnout, je jejich individualita. Pokud štěňata nejsou již od chovatele zvyklá na tělesný kontakt s člověkem, v budoucnu u nich převládne přirozený odpor k cizím individualitám. Svého nového pána se štěně sice bát nebude, ale velmi důsledně se bude vyhýbat pohlazení a na vodítko se nechá připnout jen velmi neochotně. Proto je u tohoto plemene velmi důležité znát rodiče, seznámit se s prostředím, odkud štěně pochází. Ideální povaha je velmi důležitým aspektem zařazení konkrétního psa nebo feny do chovu. Nákupem štěněte bez PP majitel riskuje, že jedním z rodičů bude jedinec vyřazený z chovu právě pro svoji problematickou povahu, která je obvykle dědičná. Výchova je v případě shiby kompromisem mezi tím, co chceme, aby pes udělal a tím, co on je ochoten udělat v rámci svých představ. Vše, co shiba dělá, je zaměřeno k jejímu osobnímu prospěchu. Poslechne-li svého pána, je to jen proto, aby se vyhnula zbytečným problémům. Pokud je ale přesvědčena o tom, že to, co dělá, je správné, nezastraší ji žádné domlouvání a tresty. Chce být vždy a ve všem první a nejdůležitější. Nesnáší jiné psy ani příslušníky svého vlastního plemene. Osobnost psa či feny plemene shiba inu vyžaduje účast zkušeného majitele, případně toho, který má možnost využít včas v případě potřeby pomoc cvičitele nebo trenéra. Socializaci, výchově a výcviku je třeba se věnovat od útlého věku a nezanedbat žádný z jejích důležitých aspektů. Majitel by proto měl být vytrvalý, neústupný a trpělivý s opakováním a neustálým procvičováním povelů. Při výcviku je důležité pamatovat na vhodné a zdravé pamlsky. Nejvhodnější výcvikovou odměnou je sušené maso, ideálně Yoggies Sušené maso hovězí, Yoggies krůtí výcvikové pamlsky. Střídat je mohou také psy a štěňaty oblíbené lyofilizované pamlsky Yoggies.
